Pri vnútornom užívaní koreňa kostihoja sa využívajú jeho adstringentné (zvieravé) účinky. Ľudové liečiteľstvo ho používalo pri ochoreniach dýchacích ciest a sliznice, pri kašli, bronchitíde a tuberkulóze. Ďalej sa aplikoval pri žalúdočných ťažkostiach, dokonca aj pri žalúdočných a dvanástnikových vredoch, maternicových krvácaniach a pri lymfatických opuchoch.
Z koreňa pripravujeme odvar nasledujúcim postupom. Lyžičku koreňovej drogy zalejeme 0,3 litra vody a cez noc necháme macerovať. Ráno potom privedieme do varu, povaríme 1 až 2 minúty a precedíme. Pijeme 2-krát denne po 0,1 litra. Odvar je vhodný na vonkajšie použitie na vredy, opareniny či omrzliny, ale aj na kloktanie či obklady.
Najčastejšie a aj vedecky uznávané je vonkajšie aplikovanie kostihoja, pričom sa uplatňujú jeho výnimočné regeneračné schopnosti. Podporuje rast kostných, chrupkových a svalových buniek, regeneráciu tkanív a pôsobí protizápalovo. Jeho aplikácia je vhodná napríklad pri kostných zápaloch, osteomyelitíde (zápal kostnej drene), poraneniach, vykĺbeninách, stavoch po amputácii, pri zle sa zrastajúcich, hlbokých či hnisavých ranách, ale aj pri podvrtnutí, pomliaždeninách, podliatinách, výronoch, pri zápaloch šliach a svalov.